KAI Siap Melayani Saat Libur Natal dan Tahun Baru, Berikut Daftar Kereta Api di Yogyakarta

- KA Bogowonto, relasi Lempuyangan - Pasarsenen pp

- KA Gajahwong, relasi Lempuyangan - Pasarsenen pp

- KA Fajar Utama Yogya, Yogyakarta - Pasarsenen

- KA Senja Utama Yogya, Pasarsenen - Yogyakarta

- KA Joglosemarkerto, relasi Solobalapan - Purwokerto - Semarang pp (2 KA)

- KA Sri Tanjung, relasi Lempuyangan - Ketapang pp

- KA Bengawan, Lempuyangan - Pasarsenen pp

- KA Progo, Purwosari - Pasarsenen pp

- KA bandara YIA, Yogyakarta - Kebumen (2 pp)

KA yang lewat wilayah Daop 6 Yogyakarta , ada 32 KA yaitu : 

- KA Argo Wilis, relasi Surabaya - Bandung pp

- KA Bima, relasi Surabaya - Gambir pp

- KA Turangga, relasi Surabaya - Bandung pp

- KA Mutiara Selatan, relasi Surabaya - Bandung pp

- KA Malabar, relasi Malang - Bandung pp